De acuerdo con los registros del Ministerio de Salud Pública (MSP), la parroquia de El Quinche cuenta con un Centro de Salud público tipo A de nivel 1, que ofrece los servicios de emergencia, medicina general y familiar, odontología, internación, enfermería y procedimientos diagnósticos y terapéuticos.
Otros indicadores significativos para analizar el manejo de la salud son la mortalidad y el índice de embarazo adolescente. El porcentaje de embarazos adolescentes de la parroquia es del 16,23% y se encuentra alrededor del promedio presentado por las parroquias rurales de Quito.
Respecto a la mortalidad, la principal causa de muerte en la parroquia son las enfermedades pulmonares como la neumonía, a continuación, se ubica la diabetes y seguido las enfermedades cardíacas y los infartos. (MSP, 2018).